单细胞组学引用搜索

任务信息

• 任务 ID：task-biology-scRNA
• 模块：citation
• 学科：生物学 / 单细胞组学
• 测试深度：L3
• 判定：FAIL

任务描述

在 Nature 系列期刊中搜索与以下文本相关的学术引用。

Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) reveals immune cell heterogeneity in tumors that is obscured by bulk transcriptomics.

执行命令

python nature_citation.py --text "Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) reveals immune cell heterogeneity in tumors that is obscured by bulk transcriptomics." --scope nature --from-year 2020 --output-file citations.enw

执行结果

FAIL — 源码 bug 导致脚本崩溃

错误详情

Traceback (most recent call last):
  File "nature_citation.py", line 2011, in <module>
    main(sys.argv[1:])
  File "nature_citation.py", line 1976, in main
    all_errors.extend(doi_errors)
NameError: name 'all_errors' is not defined

错误分析

nature_citation.py 第1976行 all_errors.extend(doi_errors) 中 all_errors 变量未定义。这是重构遗漏，导致所有调用路径崩溃。

产出

无有效产出 — 脚本在 ENW 写入前崩溃，未生成任何引用文件或分析工件。

修复建议

• 第1976行：all_errors → errors
• 第1977行：all_references → references